旅游发票的差额计算主要涉及以下几个步骤：

计算销售额

销售额是指旅行社销售旅游产品或服务的总金额，包括收取的全部价款和价外费用。

计算进项税额

进项税额是指旅行社在购买旅游产品或服务时支付的增值税额。

计算差额

差额是指用销售额减去进项税额得到的金额，即应纳税的差额。

选择税率

根据当地税务机关的规定，选择适用的增值税税率进行计算。

开具发票

旅行社在开票软件中选择差额开票功能，输入收款金额和成本金额，系统会自动计算出应纳税额，并生成发票。在发票备注栏中注明“差额征税”及扣除的具体金额。

发票类型

提供旅游服务未选择差额征税的，可以就取得的全部价款和价外费用开具专票，其进项税额凭合法扣税凭证扣除。

选择差额征税的，差额扣除部分不得开具专票，可以开具普票。

示例计算

假设某旅行社销售旅游产品，收取的总金额为100,000元，支付给其他单位或个人的住宿费、餐饮费、交通费、签证费、门票费共计30,000元，支付给其他接团旅游企业的旅游费用为10,000元。

销售额：

100,000元

进项税额：

假设为5,000元

差额：

100,000元 - 30,000元 - 10,000元 = 60,000元

选择税率：

假设适用税率为6%

应纳税额：

60,000元 × 6% = 3,600元

开具发票：

在发票备注栏注明“差额征税60,000元”，并计算出应纳税额3,600元。

通过以上步骤，旅行社可以正确计算旅游发票的差额，并按照规定开具相应的发票。