如果在旅游中丢失了通行证，可以按照以下步骤进行处理：

立即报失

尽快联系当地公安机关或出入境管理部门报失，并索要《证件遗失报警回执》。

在香港，可以拨打港铁报失电话 （852） 2861 4375 进行报失。

申请临时通行证

在确认通行证丢失后，可以先到当地的中国旅行社或公安机关出入境管理部门咨询并申请临时通行证，以便能够返回内地。

补办正式通行证

准备必要的补办材料，包括身份证、户口簿、近期的照片等。

根据当地出入境管理部门的要求，填写申请表并提交相关材料。

缴纳补办费用，并等待通知领取新的通行证。

注意事项

补办通行证的具体流程和所需材料可能因地区而异，建议提前咨询当地出入境管理部门或通过官方网站获取详细信息。

如果通行证是在境外丢失，可能需要按照当地法律程序进行报失和补办。

通过以上步骤，可以尽量减少因丢失通行证带来的不便，并尽快恢复正常的出入境活动。