公司组织员工旅游柬埔寨时，需要遵守相关法律法规和政策，确保活动的合法性。以下是一些建议：

合法签证：

确保所有员工都持有合法的柬埔寨签证。如果员工已经以旅游签证入境，需要出境后再重新申请商务签证入境。通常的做法是让员工陆路出境到越南，再返回柬埔寨，并由柬埔寨当地旅行社等代办相关手续。

遵守法律：

带领雇员赴柬埔寨是否违法，关键在于遵守相关法律与政策规定。商务往来和正常的工作交流属于在许可范围内的活动，只要依法申请出入境签证即可。避免涉及非法劳务输出或非法经营等非法定目的，以免构成违法行为。

防疫措施：

根据柬埔寨旅游部的警告，旅游领域企业或从事者必须严格落实防疫措施。这包括注册使用旅游部设定的Telegram Bot电报系统，以便登记游客信息。未遵守相关防疫措施的企业可能会面临吊销营业执照的处罚。

法律保护和政府支持：

在柬埔寨投资或开展业务的中国企业，应依法注册、依法经营，并在必要时通过法律手段解决纠纷，捍卫自己的权益。同时，应聘请当地律师处理法律事务，并与中国驻柬埔寨使馆经商参处保持密切联系，及时反映遇到的问题，以获得更多的支持和帮助。

使领馆保护：

中国公民在柬埔寨的行为主要受国际法及驻在国当地法律约束。遇有合法权益受到侵害的情况，中国驻外使、领馆有责任在国际法及当地法律允许的范围内实施保护。中资企业在进入柬埔寨市场前，应征求中国驻柬埔寨使馆经商参处的意见，并在必要时向其报到备案。

综上所述，公司组织员工旅游柬埔寨时，应确保所有活动的合法性，遵守相关法律法规，采取必要的防疫措施，并寻求法律保护和支持。